按照王振宇的设想，整个国民政府的组建分成两个部分，第一步是在上海就合并组建执政党，确定政治纲领，组织架构，把该谈的都谈好了，然后是第二步，大家从上海移到南京或是武汉，在南京或是武汉召开国民大会。
那么第一步在上海进行就不可能不引起各方关注了，青年军驻扎在上海的第一师就肩负了全部的安全保卫工作，王振宇还以国社党最高统帅部的名义任命陶峙岳为上海卫戌区司令，为了加强这次谈判的透明度，同时避免有人混淆视听，王振宇还做了一个特殊安排，效仿后世的新闻发布会制度，在每天会议结束后，召开新闻记者发布会，通报最新的提案和会议进度，以正视听，这个办法开创了中国政治之先河，而被选择担任这次谈判新闻发言人的是有中国第一记者之称的黄远生，至于邵飘萍，他对于公职兴趣不大，他更愿意激扬文字，指点江山。
至于合并方案，王振宇这边也拿出了很实际的东西，这一点就是孙文他们比不了的了。
在政体方面，王振宇提出了三权分立加军政一体的模版，具体來说，就是未來的国民政府严格意义上只是国民大会涉及民事部分决策的执行机构，其本身沒有军队，军队是属于独立于国民政府之外的军事委员会的，设立最高法院，该机构亦独立于政府之外。
国民政府，国民军事委员会，国民最高法院三大机构同时对国民大会负责。
国民大会代表南方九省一万万八千万国民之共同利益，按照王振宇的思路，国民大会代表按照地域和人口比例选举，其中地域代表108人（每省12人），人口代表180人（每一百万人1人），此外还有各界代表（由各行业推举）42人，社会名流独立代表30人，合计360人，外加议长共计是361人，代表或者说国大议员任期为四年，他们将组成财政，外交等二十七个工作委员会，负责指导和监督国民政府的日常工作。
国民政府不同于中央政府，其性质是地方政府，所以不设总理。
国民政府主席为国民政府第一责任人，设专职副主席一名，非专职副主席二名，下设政务院、监察院、考试院三院，但是行政部门基本都在政务院，后二院是监督部门。
值得一提的是，国民政府和北京政府不同的是，其沒有独立的陆军部和海军部。
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