碇真嗣的母亲名为绫波唯在他还很小的时候就死了。
以碇真嗣当时的年纪大概已经忘记了，实际上他见过母亲出事的场景，最初的eva初号机控制系统计划采用的是直接插入s2机关的方式，这一系统的发明者正是绫波唯，同时也自愿成为第一个实验对象。
结果实验当然是失败了，绫波唯直接消失在初号机体内，最终反而成为了初号机的控制系统，也是使得初号机几乎成为碇真嗣专属机体的根本原因。
这一点在新旧剧场版中差不多，虽然方式不同，不过碇真嗣的母亲都是在初号机的第一次启动中被吸收了。
也是从那时候开始，或许是刻意，或许是真的太忙，碇源渡再也没有真正出现在碇真嗣面前，于是童年时代的碇真嗣就在事实上落入了没有父母照看的境地。
当然基本的安全和教育都是没问题的，毕竟在这个少年的身后永远跟着数量不明的特务人员，保证他顺利成长只是最基本的任务。
碇真嗣清楚自己是被特殊照顾的情况，毕竟那么小一个孩子，独自生活的过程中难免也会遇到一些情况需要帮助。
也正是这种绝不同于其他同龄人的特殊待遇，再加上没有获得过家庭的温暖，最终就导致了碇真嗣如今性格的形成。
听话，懦弱内向，又容易在某些时候走极端。
而这一切尽在碇源渡的掌控。
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